Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms