Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms