Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms