Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COG7P83436 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COG7P83436 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COG7P83436 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COG7P83436 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COG7P83436 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COG7P83436 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COG7P83436 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COG7P83436 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COG7P83436 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms