Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms