Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms