Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms