Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB15P59190 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB15P59190 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB15P59190 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB15P59190 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms