Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BACE1P56817 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BACE1P56817 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms