Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPAP53621 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPAP53621 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms