Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RAB5CP51148 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB5CP51148 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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