Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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