Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PCP4P48539 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PCP4P48539 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PCP4P48539 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PCP4P48539 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PCP4P48539 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PCP4P48539 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PCP4P48539 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PCP4P48539 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PCP4P48539 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 ACSM2B-202ENST00000414188 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PCP4P48539 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PCP4P48539 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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PCP4P48539 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PCP4P48539 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 NR2E1-201ENST00000368983 2612 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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