Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCLMP48507 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCLMP48507 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms