Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms