Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCR1P46094 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCR1P46094 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms