Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSG1P42857 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSG1P42857 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSG1P42857 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSG1P42857 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSG1P42857 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSG1P42857 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSG1P42857 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSG1P42857 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms