Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MLH1P40692 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms