Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms