Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6V1E1P36543 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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