Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms