Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms