Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP2P29373 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms