Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms