Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms