Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms