Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD247P20963 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD247P20963 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms