Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms