Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DPA1P20036 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms