Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CTRB1P17538 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CTRB1P17538 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CTRB1P17538 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CTRB1P17538 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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