Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPCAMP16422 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms