Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms