Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IFITM1P13164 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms