Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms