Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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