Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms