Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C4BP0C0L5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4BP0C0L5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms