Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF2P04141 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSF2P04141 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSF2P04141 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSF2P04141 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSF2P04141 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSF2P04141 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSF2P04141 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSF2P04141 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms