Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CCNDBP1O95273 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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