Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSL4O60488 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms