Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms