Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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