Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COCHO43405 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COCHO43405 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COCHO43405 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms