Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC11O43248 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC11O43248 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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