Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms