Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6BO15054 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6BO15054 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms