Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms