Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PRAMEF25A6NGN4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PRAMEF25A6NGN4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PRAMEF25A6NGN4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PRAMEF25A6NGN4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PRAMEF25A6NGN4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PRAMEF25A6NGN4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PRAMEF25A6NGN4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PRAMEF25A6NGN4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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