Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms