Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms